Neo

Thomas Anderson trabalha como um programador de software e em suas horas vágas é um hacker e se chama Neo. Ele se torna o escolhido e quando ele se encontra com Smith, o agente muda de personalidade e se torna exatamente o contrario de Neo, depois disso Smith procura Neo por todo lugar da Matrix, e Neo tenta ficar na Matrix para achar respostas para suas diversas perguntas que ainda permanecem em branco para ele. Enquanto isso Smith transforma todos seres que encontra pela Matrix em si mesmo ou seja fica fazendo várias cópias para poder reforçar seu exercito e seu poder para poder combater Neo com mais reforços e assim também transforma-lo em uma cópia de si mesmo.